Système d'information pour l'étude de la genèse et du développement de la maladie cancéreuse

Le système d'information entre dans une optique de traitement haut débit des données transcriptomiques dont l'objectif est la détection de facteurs génétiques et la compréhension de leurs rôles dans le développement des maladies cancéreuses. Ces travaux doivent aboutir à la création d'outils de diagnostic et de pronostic de ces maladies.

M. BIGNON Yves-Jean

CENTRE JEAN PERRIN

Système d'Information pour la prise en charge et la recherche des leucodystrophies

L’objectif premier du programme est de constituer l’ensemble du système d’information (outils et données) pour l’étude des leucodystophies. Cela permettra de mettre en place à court terme les outils nécessaires à la réalisation du PHRC national obtenu en 2005. Ce travail a pour objectif de déterminer l’histoire naturelle et les paramètres de suivi des leucodystrophies liés à des mutations du gène PLP afin de mettre en place des stratégies thérapeutiques, au sein du Centre d’Investigation Clinique labellisé INSERM (CIC).

Mme BOESPFLUG-TANGUY Odile

CHU Clermont-Ferrand

Système d'Information dédié au fonctionnement de la plate-forme de recherche du CIC

L’objectif est de développer un système d’acquisition automatisé, fiable, efficace et rapide, des quelques milliers (ou parfois quelques dizaines de milliers) de données cliniques et biologiques que génère chaque étude. D’autre part, les démarches actuelles de recherche clinique intègrent de plus en plus des approches génomiques, transcriptomiques, métabolomiques et protéomiques dans les explorations physiologiques et physiopathologiques ou pour la compréhension du mécanisme d’action des médicaments chez l’Homme.

M. DUBRAY Claude

Centre d'Investigation Clinique

Système d'Information régional biomédical

Le projet est décomposé en 5 étapes successives qui consistent à remettre à jour le catalogue des sources de données exploitables, à sélectionner les sources de données bio-informatiques utiles, à définir et programmer la structure de la base de données régionale, à créer une plate-forme d’algorithmes de traitements de données transcriptomiques et à former les structures locales à l’utilisation de ce système.

ROMOND Pierre-Charles

Université d'Auvergne Clermont-Ferrand

SI pour l’utilisation d’images médicales pour les planifications de traitements par simulations MC

Le but du projet est de développer un système d’information pour l’utilisation d’images médicales dans la modélisation du dépôt de doses par simulation Monte Carlo sur grille. Deux grands axes sont à développer pour ce projet qui tiennent compte des développements réalisés ces trois dernières années par l’équipe PCSV (Plate-forme de Calcul pour les Sciences du Vivant) en collaboration avec le service de radiothérapie du Centre Jean Perrin :
1°) La distribution optimisée des calculs Monte Carlo sur grille. Ceci implique : a)Une gestion optimale des simulations sur grille pour obtenir des gains en temps de calcul significatifs. b) Une soumission transparente préservant la confidentialité des données médicales des simulations GATE pour le personnel médical et les acteurs de la recherche.
2°) La gestion, le stockage et l’accès sécurisé aux images médicales. Ceci implique : a) Le développement d’une interface entre le système PACS et la grille de calcul b)La gestion optimale et sécurisée des images médicales sur grille pour les simulations Monte Carlo GATE

MAIGNE Lydia

LPC Clermont-Ferrand

LifeGrid, le système d'information régional